生物/化学信息学

发布者:生物分析化学院士合作研究中心发布时间:2021-09-03浏览次数:30

瞿昆

 

1)通过生物学与化学、数学、计算机科学的交叉融合,发展新型基因组学测序技术和生物大数据分析算法和软件,为解决生物医学领域的复杂问题提供各种工具。

 

ftATAC-seq 技术和 APEC 算法精确获取和解析单细胞染色质可及性信息

WEDGE 算法精准恢复单细胞转录组测序数据中基因表达的缺失信息

ATAC-pipe 软件快速解析基因组染色质可及性测序数据信息

GenomeSpace 软件系统实现基于云计算的在线生物信息分析

PIRCh-seq 组学技术实现 RNA 和染色质互作的系统性研究

该部分成果发表在Genome Biology20202019),Briefings in Bioinformatics20212019),Nature Methods2016

 

2)通过生物学与医学、计算机科学的交叉融合,利用已有和原创的各种工具,揭示重大疾病的免疫学致病机理。

 

• 发现重症新冠肺炎患者细胞因子风暴及单细胞水平免疫应答机制

• 发现皮肤 T 细胞淋巴瘤患者对抗癌药物响应的动态过程和分子机制

• 发现树突状细胞介导的免疫异常导致系统性硬化症的新机制

• 发现单核细胞介导的免疫异常导致类风湿性关节炎的新机制

该部分成果发布在Cell2021),Cancer Cell2017),Nature Communications2020a2020b),Cell Discovery2021),BMC Biology2021